3日破基因 3日尋快速診斷法 深圳華大基因研究院 解腸毒疫情主力成員

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明報明報 – 7小時前

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    迅速破解新型腸出血性大腸桿菌基因密碼的深圳華大基因研究院，全院有4000人員，有多達180部基因排序機，DNA排序能力是全球之冠。（李泉攝）放大圖片

    迅速破解新型腸出血性大腸桿菌基因密碼的深圳華大基因研究院，全院有4000人員，有多達180部基因排序機，DNA排序能力是全球之冠。（李泉攝）

【明報專訊】新型腸出血性大腸桿菌（EHEC）在歐美各國先後爆發，在歐洲最少已造成19人死亡。今次迅速破解EHEC基因之謎的，深圳的華大基因研究院。研究院人員昨接受本報專訪時表示，他們只花了3天時間便初步完成這款新型大腸桿菌的基因排序，發現該菌至少對3種主要抗生素類型有抗藥性，毒性亦非常強。研究員希望在3天後研發出針對的治療措施，有效控制疫情蔓延。

民營的深圳華大基因研究院曾在2003年SARS期間，成功以一星期時間迅速排列出SARS病毒基因排序，幫助開發出病毒疫苗。今次歐美12國爆發腸出血性大腸桿菌疫情，研究院再成為破譯及幫助應對這次疫情的主要成員。

分析成果上載 國際共用

「華大基因」市場部總監楊碧澄博士透露，德國疫情爆發後，德方專家求助華大基因在歐洲的研究員，研究院在5月23日從德國漢堡大學醫學院得到大腸桿菌樣品，花了3天時間即初步完成了基因組測序和分析，該院更把成果上載到公共數據庫，讓各國研究員和機構共享成果。

病菌結構複雜 合用藥物少

她透露，華大基因今次迅速成立專組，利用先進的第三代測序儀，對病菌進行測序和生物信息學分析，「團隊發現該菌株是一種新型，兼具侵襲、產毒、腸出血等特徵的大腸桿菌」。她說，該病菌結構奇怪複雜，有多種致病基因融合一起，「很多基因似乎是來自大腸桿菌，因而具有導致腸出血的能力」，治療亦比較困難。研究又發現，該菌株攜有氨基糖甙類、大環內酯類、磺胺類等抗生素的抗藥基因，由於這些抗生素都是常用於治療腸胃感染的第一線藥物，導致合用的治療藥物種類更少。

正測試快速診斷試劑

世衛專家昨日亦表示，導致今次疫潮的大腸桿菌很罕見，過去雖然曾有在人類身上發現的個案，但從未試過爆發。楊碧澄說，目前仍未知此大腸桿菌的來源，不能排除此菌曾長期存在，只是不為人知。他們經過對比基因圖庫，發現這種大腸桿菌與2002年從非洲中部愛滋病患者腹瀉樣本中分離的腸侵襲性大腸桿菌株有96%相似，是與另一種大腸桿菌出現基因變異變成的新品種。

該院會繼續研究，通過對基因序列了解該病菌的特性，期望3天後可以找出針對診斷、監測等方案。「我們在研發快速診斷試劑，現正作測試，希望用來測出食物和病人體內是否有這種病菌。」

「研究院的合作伙伴可以通過此成果，應用到臨牀上，研製出有效的藥物和採取預防措施。希望愈快愈好。」

明報記者 李泉 深圳報道